Skrining kesehatan adalah bentuk deteksi dini untuk penyakit yang berpotensi menimbulkan biaya besar. Ada dua jenis skrining kesehatan yang ditanggung BPJS Kesehatan. Pertama, skrining untuk preventif primer atau skrining riwayat kesehatan. Skrining ini dilakukan untuk mendeteksi penyakit yang menjadi fokus pengendalian BPJS Kesehatan, yaitu Diabetes Melitus Tipe 2 dan Hipertensi.
Kedua, skrining untuk preventif sekunder selektif. Skrining ini ditujukan bagi peserta yang memiliki resiko tinggi terhadap penyakit kronis berdasarkan hasil skrining riwayat kesehatan dan deteksi kanker. Deteksi kanker merupakan pencegahan dini terhadap kanker leher rahim pada wanita yang sudah menikah dan kanker payudara.