Design dari line sangat flexible dan banyak peralatan yang dioperasikan, di sambung dan di cleaning secara manual, hal ini menjadi salah satu penyebab terjadinya cross contamination pada produk yang dihasilkan. Kondisi lantai proses banyak yang mengelupas, atap bocor juga merupakan penyebab terjadinya cross contamination. Hal ini terlihat dari banyaknya kasus coliform dan TPC yang tinggi pada finished product yang dihasilkan