Penyakit TB di Indonesia masih merupakan masalah kesehatan masyarakat dan merupakan salah satu penyakit menular yang mematikan. Pada tahun 2013, estimasi kasus TB sebesar 9 juta kasus dan yang meninggal sebesar 1,5juta orang, diantara kasus tersebut terdapat kasus HIV karena TB sebesar 360.000 ribu kasus,walaupun kematian karena TB dapat dicegah pada kenyataannya kematian akibat terinfeksi kuman tuberculosis masih tinggi sehingga perlu penangggulangan TB sesuai dengan target MDGs (Millenium Development Goals), target MDGs menetapkan penurunan prevalensi TB sebesar 50% dari tahun 1990 sampai tahun 2015.
Puskesmas serta RS di Indonesia sudah menerapkan strategi DOTs( Directly Observed Treatment Short Course) dengan target penemuan kasus TB sebesar 70% di masyarakat dan keberhasilan pengobatan mencapai 85%, namun target tersebut tidak tercapai. Berdasarkan data prevalensi TB 2013/2014 pada 33 provinsi di Indonesia dan 156 cluster dilaporkan prevalensi TB dalam konfirmasi bakteriologis sebesar 759/100.000 penduduk. Hasil tersebut lebih tinggi daripada yang diperkirakan sebelumnya (SPTB 2013-2014).
Untuk identifikasi terhadap TB-MDR perlu dikembangkan metode terkini seperti: menggunakan Genoscholar dengan Line Probe Assay (LPA) kits yang dapat mendeteksi PZA (Pyrazinamide), RFP (Rifampicin), INH (Isoniasid) dan NTM (Non Tuberculosis Mycobacteria) serta resistensi obat antibiotik seperti contoh tersebut, keuntugan dari identifikasi tersebut dapat mendeteksi mutasi strain atypical seperti tuberculosis, M.tuberculosis, M. avium, M. intracelulars, M.kansasii. Metode identifikasi tersebut sudah digunakan di Thailand dan Jepang pada tahun 2013. Genoscholar NTM+MDR-TB juga mampu mendeteksi bakteri M.avium,M.intracellulare and M.kansasii dengan sensitivitas 98,9% dan spesifitas 97,3% melalui intrepetasi mata secara akurat dari ekstraksi DNA. Studi di Jepang menunjukkan sensitivitas Genoscholar terhadap RFP sebesar 99,6%, spesifitas dengan menggunakan kultur isolat sebesar 95% dan sensitivitas sebesar 99,1% serta spesifitas 100% untuk mendeteksi RFP dengan menggunakan sputum pasien. Sampai sejauh ini belum ada data pendukung pemeriksaan NTM+MDR-TB dengan menggunakan Genoscholar dan ini akan menjadi keuntungan untuk mendapatkan data NTM+MDR-TB sekaligus sebagai pemetaan NTM species atypical di Indonesia untuk mendapatkan prevalensinya. Preeliminary studi dilaksanakan di laboratorium RSUP Persahabatan Jakarta,selanjutnya akan diikuti pada tiga provinsi di Indonesia (Laboratorium RSUP. Adam Malik Medan, Laboratorium Universitas Hassanuddin Makasar, RSUP Persahabatan Jakarta). Tujuan dipilihnya ketiga laboratorium tersebut karena sumber daya manusia memenuhi syarat, jumlah pasien TB mencukupi untuk ikut dalam survei ini. Diharapkan hasil penelitian ini dapat menggambarkan penemuan prevalensi MDR TB dan NTM TB di Indonesia, dalam upaya penanggulangan penyakit TB paru di Indonesia.