Upaya perlindungan keanekaragaman hayati difokuskan kepada 6 indikator utama yaitu: hutan dan lahan gambut lestari, kebakaran lahan gambut, subsiden lahan gambut, penetapan lahan pangan berkelanjutan, deliniasi kawasan hutan dan non hutan, dan deliniasi kawasan pengembangan. Uraian masing-masing indikator adalah sebagai berikut: